Prof. dr. Roman Jerala in prof. dr. Sandi Klavžar: Sintezna biologija, kako lahko pomagajo matematiki?
Date of publication: 26. 5. 2013
Mathematics colloquium
Četrtek, 30. 5. 2013, ob 18:15 v predavalnici 2.02 na Jadranski 21.
Roman Jerala in Sandi Klavžar
Kemijski inštitut Ljubljana in Fakulteta za matematiko in fiziko, Ljubljana
Sintezna biologija vnaša inženirske pristope v biološke sisteme, kar omogoča številne možnosti uporabe ter poglobljeno razumevanje bioloških procesov. Predstavili bomo nekaj novejših dosežkov kot je dizajn logičnih operacij v celicah z načrtovanjem in pripravo bistabilnih stikal. Biološki polimeri omogočajo tvorbo zelo kompleksnih struktur, kot so proteini v vseh organizmih. Predstavili bomo nov način modularnega sestavljanja polipeptidnih struktur, ki omogoča tvorbo struktur, ki se razlikujejo od naravnih. V drugem delu predavanja bomo predstavili matematični model, ki opisuje sestavljanje polipeptidnih poliedrov. Gre za stabilne dvojne obhode v grafih poliedrov; pri tem stabilnost obhoda pomeni, da je brez takojšnje ponovitve in da v nobenem vozlišču nima t.i. ponavljanja. Za poljuben graf velja, da premore stabilni dvojni obhod natanko tedaj, ko ima graf minimalno stopnjo vsaj tri. Predstavljeni bodo tudi posebni stabilni dvojni obhodi - paralelni in antiparalelni - saj so zanimivi iz vidika biotehnoloških aplikacij. Sodelavec pri teh raziskavah je bil Jernej Rus.
