Raziskovalni projekt (so)financira Javna agencija za raziskovalno dejavnost RS.
Članica UL: Fakulteta za matematiko in fiziko
Šifra projekta: N3-0348
Naziv projekta: Optična diagnostika kožnih infekcij
Obdobje: 1. 1. 2024 - 31. 12. 2027
Letni obseg: 0,89 FTE, cenovna kategorija: C
Vodja: Matija Milanič
Veda: Naravoslovje
Sodelujoče RO, sestava projektne skupine in bibliografske reference
Vsebinski opis projekta:
Glavni cilj predlagane raziskave je prenos optičnih diagnostičnih v klinično prakso in klinične mikrobiološke laboratorije (FLA) za hitrejšo in natančnejšo identifikacijo in diskriminacijo mikrobov, ki povzročajo kožne okužbe (SSTI). Specifični cilji raziskave so:
- Spektralno slikanje mikrobnih kultur SSTI. Mikrobne kulture običajnih mikrobov SSTI bodo slikane z uporabo odbojnosti/prepustnosti v spektralnem področju VIS-NIR, fluorescence in Ramanskega slikanja. Morfologijo kolonij bomo pregledali z optično koherentno tomografijo (OCT). Za gojenje mikrobov bodo uporabljeni različni substrati, ki simulirajo FLA okolje in prave kožne okužbe.
- Spektralno slikanje SSTI in vivo. Bolnike s SSTI bomo slikali s posebej razvitim optičnim slikovnim sistemom in sistemom OCT.
- Razvoj standardiziranih poti za obdelavo slik. Zbrane slike bodo uporabljene za razvoj poti za obdelavo zajetih slik (IPPL) z namenom optimalne občutljivosti in specifičnosti identifikacije in diferenciacije mikrobov SSTI za FLA in klinični pregled. Učinkovitost mikrobne klasifikacije bo potrjena glede na standardne diagnostične tehnike.
- Izdelava javno dostopne baze slik. Izdelana bo spletna baza podatkov za shranjevanje, dostop in obdelavo SSTI slik mikrobnih kultur (1) in in-vivo slik bolnikov (2).
Rezultati teh raziskav, vključno s standardizacijo poti za obdelavo spektralne slike, bodo omogočili lažji prenos teh tehnologij v klinično prakso. Uporaba rezultatov te študije bo tudi omogočila raziskave in razvoj novih kliničnih diagnostičnih tehnik in ustreznih načinov obdelave slik.
