Pediatrična klinika
Si pripravljen/-a sprejeti izziv in se pridružiti projektu, ki bo Slovenijo postavil na svetovni zemljevid genomskih raziskav? Klinični inštitut za specialno laboratorijsko diagnostiko, Pediatrične klinike, UKC Ljubljana, išče raziskovalca iz področja bioinformatike za delo na Slovenskem referenčnem genomskem projektu (SRGP, ARIS: J7-60116).
Tvoja vloga:
Kot del raziskovalne skupine prof. Battelina boš sodeloval/-a pri ključnih raziskavah na področju razvoja in optimizacije bioinformatskih postopkov za sestavljanje (assembly) humanega genoma, vključno z uporabo najnovejših tehnologij dolgega branja in de-novo sestavljanja, izgradnje slovenske pangenomske reference in upravljanje kompleksnih genomskih podatkov v skladu z mednarodnimi standardi (FAIR, GA4GH, GDPR, …). Prav tako pa boš tudi sodeloval/-a pri pripravi T2T (telomere-to-telomere) nacionalne genomske reference za izboljšanje razumevanja genomske raznolikosti slovenske populacije.
Kaj nudimo?
- Delo na vrhunskem raziskovalnem projektu z neposrednim vplivom na napredek personalizirane medicine in diagnostike redkih bolezni v Sloveniji.
- Priložnost za sodelovanje z vodilnimi slovenskimi in mednarodnimi raziskovalnimi inštitucijami.
- Dostop do najsodobnejše laboratorijske opreme, vključno z PromethIONTM, NovaSeq 6000 in lastno HPC infrastrukturo.
- Pridružitev interdisciplinarni ekipi z znanjem in izkušnjam iz uporabe thenologij sekvenciranja dolgih odčitkov, ustreznih bioinformatskih orodij in ustvarjanje pangenomskih grafov.
Kaj pričakujemo?
- Magisterij ali doktorat iz področja bioinformatike, genomike, računalništva, biotehnologije ali sorodnega področja.
- Izkušnje z analizami genetskih podatkov, de-novo sestavljanjem genomov ali pangenomskimi grafi so prednost.
- Znanje programiranja (Python, R, ali C++). Izkušnje dela z visokozmogljivimi računalniškimi sistemi (HPC) so prednost.
- Sposobnost timskega dela in samoiniciativnost pri raziskovanju.
Kako se prijaviš?
Pošlji svoj CV in motivacijsko pismo na naslov: jernej.kovac@kclj.si. Prijave sprejemamo do zapolnitve mesta.
Za vsebino oglasa, nadaljnji proces izbire kandidata in obliko medsebojnega sodelovanja med kandidatom in delodajalcem odgovarja delodajalec. Več informacij je na voljo tu.
